Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCM3P25205 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCM3P25205 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM3P25205 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM3P25205 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM3P25205 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM3P25205 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM3P25205 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM3P25205 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM3P25205 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM3P25205 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM3P25205 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM3P25205 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM3P25205 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM3P25205 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM3P25205 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM3P25205 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM3P25205 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM3P25205 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM3P25205 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM3P25205 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM3P25205 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM3P25205 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM3P25205 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM3P25205 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM3P25205 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM3P25205 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM3P25205 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM3P25205 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM3P25205 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM3P25205 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM3P25205 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCM3P25205 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCM3P25205 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCM3P25205 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCM3P25205 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCM3P25205 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCM3P25205 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCM3P25205 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCM3P25205 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCM3P25205 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCM3P25205 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCM3P25205 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MCM3P25205 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCM3P25205 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCM3P25205 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCM3P25205 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCM3P25205 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCM3P25205 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCM3P25205 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCM3P25205 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCM3P25205 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MCM3P25205 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCM3P25205 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCM3P25205 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCM3P25205 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCM3P25205 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MCM3P25205 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCM3P25205 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCM3P25205 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCM3P25205 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCM3P25205 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCM3P25205 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCM3P25205 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCM3P25205 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCM3P25205 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCM3P25205 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCM3P25205 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCM3P25205 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCM3P25205 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCM3P25205 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCM3P25205 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCM3P25205 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCM3P25205 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCM3P25205 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCM3P25205 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCM3P25205 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCM3P25205 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCM3P25205 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MCM3P25205 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCM3P25205 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MCM3P25205 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCM3P25205 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCM3P25205 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCM3P25205 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCM3P25205 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCM3P25205 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCM3P25205 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCM3P25205 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCM3P25205 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCM3P25205 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MCM3P25205 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCM3P25205 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCM3P25205 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCM3P25205 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCM3P25205 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCM3P25205 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCM3P25205 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCM3P25205 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MCM3P25205 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms