Protein–RNA interactions for Protein: P23975

SLC6A2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A2P23975 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A2P23975 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A2P23975 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms