Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYT1P21579 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SYT1P21579 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SYT1P21579 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SYT1P21579 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYT1P21579 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYT1P21579 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYT1P21579 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT1P21579 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT1P21579 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT1P21579 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT1P21579 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT1P21579 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT1P21579 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT1P21579 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT1P21579 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT1P21579 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT1P21579 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT1P21579 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT1P21579 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT1P21579 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT1P21579 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT1P21579 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT1P21579 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT1P21579 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT1P21579 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT1P21579 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT1P21579 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT1P21579 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT1P21579 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT1P21579 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT1P21579 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT1P21579 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT1P21579 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT1P21579 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT1P21579 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT1P21579 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT1P21579 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT1P21579 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT1P21579 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT1P21579 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT1P21579 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT1P21579 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT1P21579 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT1P21579 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT1P21579 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT1P21579 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT1P21579 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT1P21579 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT1P21579 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT1P21579 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT1P21579 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT1P21579 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT1P21579 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT1P21579 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT1P21579 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT1P21579 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT1P21579 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT1P21579 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT1P21579 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT1P21579 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT1P21579 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT1P21579 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT1P21579 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT1P21579 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT1P21579 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT1P21579 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYT1P21579 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYT1P21579 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYT1P21579 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYT1P21579 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYT1P21579 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYT1P21579 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYT1P21579 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYT1P21579 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYT1P21579 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYT1P21579 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYT1P21579 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYT1P21579 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SYT1P21579 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYT1P21579 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYT1P21579 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYT1P21579 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYT1P21579 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYT1P21579 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT1P21579 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT1P21579 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT1P21579 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT1P21579 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT1P21579 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT1P21579 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT1P21579 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT1P21579 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT1P21579 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT1P21579 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT1P21579 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT1P21579 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT1P21579 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT1P21579 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT1P21579 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms