Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACO1P21399 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACO1P21399 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACO1P21399 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACO1P21399 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACO1P21399 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACO1P21399 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACO1P21399 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACO1P21399 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACO1P21399 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ACO1P21399 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACO1P21399 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACO1P21399 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACO1P21399 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACO1P21399 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACO1P21399 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACO1P21399 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACO1P21399 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACO1P21399 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACO1P21399 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACO1P21399 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ACO1P21399 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACO1P21399 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACO1P21399 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACO1P21399 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACO1P21399 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACO1P21399 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACO1P21399 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACO1P21399 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACO1P21399 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACO1P21399 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACO1P21399 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACO1P21399 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACO1P21399 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACO1P21399 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACO1P21399 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACO1P21399 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACO1P21399 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACO1P21399 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACO1P21399 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACO1P21399 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACO1P21399 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ACO1P21399 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACO1P21399 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACO1P21399 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACO1P21399 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACO1P21399 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACO1P21399 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACO1P21399 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACO1P21399 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACO1P21399 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACO1P21399 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACO1P21399 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACO1P21399 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACO1P21399 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACO1P21399 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACO1P21399 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACO1P21399 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACO1P21399 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACO1P21399 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACO1P21399 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACO1P21399 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACO1P21399 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACO1P21399 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACO1P21399 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACO1P21399 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACO1P21399 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACO1P21399 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACO1P21399 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACO1P21399 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACO1P21399 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACO1P21399 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACO1P21399 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACO1P21399 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACO1P21399 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACO1P21399 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACO1P21399 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACO1P21399 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACO1P21399 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACO1P21399 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACO1P21399 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACO1P21399 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACO1P21399 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACO1P21399 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACO1P21399 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACO1P21399 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACO1P21399 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACO1P21399 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACO1P21399 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACO1P21399 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACO1P21399 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ACO1P21399 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACO1P21399 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACO1P21399 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACO1P21399 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACO1P21399 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACO1P21399 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACO1P21399 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACO1P21399 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACO1P21399 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms