Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms