Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NELFEP18615 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NELFEP18615 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NELFEP18615 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NELFEP18615 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NELFEP18615 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NELFEP18615 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NELFEP18615 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NELFEP18615 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NELFEP18615 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NELFEP18615 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NELFEP18615 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NELFEP18615 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NELFEP18615 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NELFEP18615 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NELFEP18615 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NELFEP18615 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NELFEP18615 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NELFEP18615 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NELFEP18615 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NELFEP18615 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NELFEP18615 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NELFEP18615 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NELFEP18615 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NELFEP18615 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NELFEP18615 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NELFEP18615 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NELFEP18615 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NELFEP18615 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NELFEP18615 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NELFEP18615 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NELFEP18615 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NELFEP18615 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NELFEP18615 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NELFEP18615 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NELFEP18615 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NELFEP18615 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NELFEP18615 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NELFEP18615 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NELFEP18615 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NELFEP18615 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NELFEP18615 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NELFEP18615 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NELFEP18615 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NELFEP18615 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NELFEP18615 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NELFEP18615 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NELFEP18615 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NELFEP18615 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NELFEP18615 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NELFEP18615 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NELFEP18615 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NELFEP18615 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NELFEP18615 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NELFEP18615 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NELFEP18615 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NELFEP18615 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NELFEP18615 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NELFEP18615 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFEP18615 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFEP18615 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFEP18615 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFEP18615 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFEP18615 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFEP18615 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFEP18615 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFEP18615 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFEP18615 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFEP18615 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFEP18615 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFEP18615 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFEP18615 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFEP18615 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFEP18615 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFEP18615 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFEP18615 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFEP18615 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NELFEP18615 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NELFEP18615 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NELFEP18615 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NELFEP18615 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NELFEP18615 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NELFEP18615 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NELFEP18615 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NELFEP18615 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NELFEP18615 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NELFEP18615 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NELFEP18615 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NELFEP18615 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NELFEP18615 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NELFEP18615 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NELFEP18615 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NELFEP18615 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NELFEP18615 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NELFEP18615 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NELFEP18615 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NELFEP18615 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NELFEP18615 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NELFEP18615 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NELFEP18615 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
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