Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRAP18433 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
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