Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms