Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCL3L1P16619 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms