Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GNB3P16520 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GNB3P16520 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GNB3P16520 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB3P16520 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB3P16520 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB3P16520 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB3P16520 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB3P16520 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB3P16520 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB3P16520 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB3P16520 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB3P16520 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB3P16520 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB3P16520 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB3P16520 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GNB3P16520 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GNB3P16520 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GNB3P16520 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GNB3P16520 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GNB3P16520 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GNB3P16520 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GNB3P16520 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GNB3P16520 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GNB3P16520 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GNB3P16520 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GNB3P16520 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GNB3P16520 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB3P16520 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB3P16520 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB3P16520 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB3P16520 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB3P16520 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB3P16520 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB3P16520 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB3P16520 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB3P16520 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB3P16520 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB3P16520 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB3P16520 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB3P16520 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB3P16520 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB3P16520 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB3P16520 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB3P16520 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB3P16520 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB3P16520 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB3P16520 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB3P16520 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB3P16520 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB3P16520 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB3P16520 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB3P16520 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB3P16520 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB3P16520 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB3P16520 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB3P16520 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB3P16520 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB3P16520 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB3P16520 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB3P16520 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB3P16520 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB3P16520 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB3P16520 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB3P16520 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB3P16520 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB3P16520 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB3P16520 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB3P16520 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB3P16520 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB3P16520 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB3P16520 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB3P16520 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GNB3P16520 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GNB3P16520 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GNB3P16520 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GNB3P16520 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GNB3P16520 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GNB3P16520 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GNB3P16520 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GNB3P16520 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GNB3P16520 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GNB3P16520 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GNB3P16520 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GNB3P16520 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GNB3P16520 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GNB3P16520 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GNB3P16520 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GNB3P16520 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GNB3P16520 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GNB3P16520 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GNB3P16520 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GNB3P16520 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GNB3P16520 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GNB3P16520 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GNB3P16520 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GNB3P16520 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GNB3P16520 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GNB3P16520 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GNB3P16520 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms