Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRAP16234 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms