Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARGP13631 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARGP13631 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARGP13631 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARGP13631 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARGP13631 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARGP13631 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARGP13631 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARGP13631 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARGP13631 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARGP13631 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARGP13631 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RARGP13631 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARGP13631 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARGP13631 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARGP13631 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARGP13631 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RARGP13631 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARGP13631 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARGP13631 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARGP13631 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARGP13631 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARGP13631 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARGP13631 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARGP13631 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARGP13631 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARGP13631 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARGP13631 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARGP13631 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARGP13631 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARGP13631 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARGP13631 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RARGP13631 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARGP13631 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARGP13631 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARGP13631 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARGP13631 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARGP13631 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARGP13631 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARGP13631 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARGP13631 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARGP13631 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARGP13631 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARGP13631 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARGP13631 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARGP13631 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RARGP13631 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARGP13631 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARGP13631 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARGP13631 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARGP13631 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARGP13631 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARGP13631 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARGP13631 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARGP13631 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARGP13631 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARGP13631 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARGP13631 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARGP13631 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARGP13631 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARGP13631 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RARGP13631 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARGP13631 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARGP13631 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARGP13631 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARGP13631 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARGP13631 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARGP13631 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARGP13631 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARGP13631 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARGP13631 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARGP13631 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARGP13631 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARGP13631 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARGP13631 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARGP13631 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARGP13631 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARGP13631 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARGP13631 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARGP13631 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARGP13631 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARGP13631 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARGP13631 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARGP13631 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARGP13631 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RARGP13631 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RARGP13631 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RARGP13631 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RARGP13631 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RARGP13631 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RARGP13631 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RARGP13631 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RARGP13631 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARGP13631 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARGP13631 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARGP13631 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARGP13631 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARGP13631 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARGP13631 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARGP13631 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms