Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKBP12277 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKBP12277 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKBP12277 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKBP12277 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKBP12277 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CKBP12277 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CKBP12277 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CKBP12277 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKBP12277 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKBP12277 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKBP12277 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKBP12277 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CKBP12277 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CKBP12277 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CKBP12277 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CKBP12277 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKBP12277 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKBP12277 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKBP12277 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKBP12277 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKBP12277 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKBP12277 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKBP12277 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKBP12277 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKBP12277 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKBP12277 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKBP12277 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKBP12277 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKBP12277 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CKBP12277 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKBP12277 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKBP12277 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKBP12277 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKBP12277 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKBP12277 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKBP12277 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKBP12277 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKBP12277 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKBP12277 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKBP12277 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKBP12277 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKBP12277 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKBP12277 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKBP12277 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKBP12277 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CKBP12277 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKBP12277 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKBP12277 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKBP12277 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKBP12277 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKBP12277 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKBP12277 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKBP12277 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKBP12277 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKBP12277 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKBP12277 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKBP12277 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKBP12277 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKBP12277 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKBP12277 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKBP12277 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKBP12277 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKBP12277 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKBP12277 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKBP12277 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKBP12277 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKBP12277 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CKBP12277 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CKBP12277 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CKBP12277 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CKBP12277 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CKBP12277 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CKBP12277 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CKBP12277 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKBP12277 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKBP12277 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CKBP12277 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKBP12277 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKBP12277 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKBP12277 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKBP12277 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKBP12277 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKBP12277 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKBP12277 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CKBP12277 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKBP12277 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKBP12277 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CKBP12277 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKBP12277 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKBP12277 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKBP12277 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CKBP12277 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKBP12277 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKBP12277 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKBP12277 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKBP12277 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKBP12277 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKBP12277 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKBP12277 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms