Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms