Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALM1P0DP23 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALM1P0DP23 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALM1P0DP23 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALM1P0DP23 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALM1P0DP23 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALM1P0DP23 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALM1P0DP23 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALM1P0DP23 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALM1P0DP23 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms