Protein–RNA interactions for Protein: P0DP03

IGHV3-30-5, Immunoglobulin heavy variable 3-30-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-5P0DP03 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGHV3-30-5P0DP03 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGHV3-30-5P0DP03 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV3-30-5P0DP03 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV3-30-5P0DP03 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV3-30-5P0DP03 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV3-30-5P0DP03 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms