Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms