Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRGAP2CP0DJJ0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2CP0DJJ0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms