Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRR35P0CG20 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRR35P0CG20 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRR35P0CG20 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRR35P0CG20 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRR35P0CG20 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRR35P0CG20 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRR35P0CG20 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRR35P0CG20 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRR35P0CG20 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms