Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms