Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M4

RHOXF2B, Rhox homeobox family member 2B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2BP0C7M4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOXF2BP0C7M4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF2BP0C7M4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF2BP0C7M4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF2BP0C7M4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF2BP0C7M4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF2BP0C7M4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF2BP0C7M4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF2BP0C7M4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF2BP0C7M4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF2BP0C7M4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF2BP0C7M4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF2BP0C7M4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF2BP0C7M4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF2BP0C7M4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms