Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TNP1P09430 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TNP1P09430 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TNP1P09430 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TNP1P09430 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TNP1P09430 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TNP1P09430 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TNP1P09430 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TNP1P09430 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TNP1P09430 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TNP1P09430 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TNP1P09430 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TNP1P09430 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TNP1P09430 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TNP1P09430 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TNP1P09430 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TNP1P09430 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TNP1P09430 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TNP1P09430 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TNP1P09430 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TNP1P09430 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
TNP1P09430 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
TNP1P09430 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
TNP1P09430 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
TNP1P09430 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
TNP1P09430 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TNP1P09430 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms