Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCB1P08183 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB1P08183 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms