Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBBP07437 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBBP07437 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBBP07437 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBBP07437 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBBP07437 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBBP07437 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBBP07437 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBBP07437 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBBP07437 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBBP07437 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBBP07437 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBBP07437 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBBP07437 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBBP07437 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBBP07437 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBBP07437 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBBP07437 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBBP07437 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBBP07437 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBBP07437 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBBP07437 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBBP07437 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBBP07437 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBBP07437 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBBP07437 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBBP07437 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBBP07437 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBBP07437 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBBP07437 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBBP07437 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBBP07437 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBBP07437 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBBP07437 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBBP07437 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBBP07437 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBBP07437 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBBP07437 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBBP07437 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBBP07437 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBBP07437 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBBP07437 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBBP07437 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBBP07437 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBBP07437 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBBP07437 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBBP07437 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBBP07437 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBBP07437 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBBP07437 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBBP07437 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBBP07437 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBBP07437 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBBP07437 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBBP07437 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBBP07437 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBBP07437 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBBP07437 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBBP07437 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBBP07437 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBBP07437 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBBP07437 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBBP07437 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBBP07437 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBBP07437 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBBP07437 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBBP07437 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBBP07437 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBBP07437 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBBP07437 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBBP07437 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBBP07437 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBBP07437 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBBP07437 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBBP07437 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBBP07437 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBBP07437 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBBP07437 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBBP07437 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBBP07437 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBBP07437 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBBP07437 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBBP07437 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBBP07437 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBBP07437 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBBP07437 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBBP07437 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBBP07437 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBBP07437 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBBP07437 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBBP07437 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBBP07437 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBBP07437 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBBP07437 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBBP07437 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBBP07437 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBBP07437 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBBP07437 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBBP07437 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBBP07437 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms