Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGAP02671 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGAP02671 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGAP02671 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGAP02671 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGAP02671 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FGAP02671 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGAP02671 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGAP02671 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGAP02671 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGAP02671 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGAP02671 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGAP02671 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGAP02671 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGAP02671 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGAP02671 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGAP02671 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGAP02671 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGAP02671 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGAP02671 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGAP02671 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGAP02671 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGAP02671 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FGAP02671 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGAP02671 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGAP02671 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGAP02671 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGAP02671 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGAP02671 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGAP02671 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGAP02671 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGAP02671 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGAP02671 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FGAP02671 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGAP02671 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGAP02671 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGAP02671 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGAP02671 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGAP02671 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGAP02671 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGAP02671 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGAP02671 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGAP02671 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGAP02671 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
FGAP02671 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGAP02671 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGAP02671 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGAP02671 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGAP02671 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGAP02671 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGAP02671 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGAP02671 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGAP02671 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGAP02671 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGAP02671 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGAP02671 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGAP02671 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FGAP02671 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGAP02671 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGAP02671 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
FGAP02671 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGAP02671 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGAP02671 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FGAP02671 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGAP02671 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGAP02671 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGAP02671 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGAP02671 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGAP02671 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGAP02671 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGAP02671 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGAP02671 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGAP02671 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGAP02671 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGAP02671 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGAP02671 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGAP02671 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGAP02671 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGAP02671 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FGAP02671 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGAP02671 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGAP02671 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGAP02671 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FGAP02671 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGAP02671 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGAP02671 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGAP02671 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGAP02671 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGAP02671 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGAP02671 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGAP02671 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGAP02671 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGAP02671 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGAP02671 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGAP02671 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGAP02671 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGAP02671 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGAP02671 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGAP02671 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGAP02671 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms