Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOEP02649 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOEP02649 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOEP02649 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APOEP02649 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOEP02649 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOEP02649 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOEP02649 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOEP02649 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOEP02649 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOEP02649 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOEP02649 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOEP02649 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOEP02649 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOEP02649 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOEP02649 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOEP02649 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOEP02649 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
APOEP02649 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOEP02649 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOEP02649 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOEP02649 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOEP02649 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOEP02649 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOEP02649 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOEP02649 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOEP02649 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOEP02649 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOEP02649 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APOEP02649 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOEP02649 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOEP02649 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOEP02649 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOEP02649 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOEP02649 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOEP02649 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOEP02649 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOEP02649 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOEP02649 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOEP02649 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOEP02649 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOEP02649 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOEP02649 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOEP02649 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOEP02649 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOEP02649 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOEP02649 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOEP02649 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOEP02649 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOEP02649 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOEP02649 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOEP02649 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOEP02649 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOEP02649 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOEP02649 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOEP02649 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOEP02649 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOEP02649 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOEP02649 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOEP02649 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOEP02649 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOEP02649 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOEP02649 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOEP02649 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOEP02649 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOEP02649 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOEP02649 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOEP02649 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOEP02649 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOEP02649 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APOEP02649 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOEP02649 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOEP02649 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOEP02649 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOEP02649 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOEP02649 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOEP02649 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOEP02649 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOEP02649 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOEP02649 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOEP02649 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOEP02649 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOEP02649 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOEP02649 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOEP02649 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOEP02649 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOEP02649 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOEP02649 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOEP02649 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOEP02649 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOEP02649 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOEP02649 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOEP02649 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOEP02649 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOEP02649 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOEP02649 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOEP02649 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOEP02649 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOEP02649 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOEP02649 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms