Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HPRP00739 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HPRP00739 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HPRP00739 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HPRP00739 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HPRP00739 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HPRP00739 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPRP00739 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPRP00739 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPRP00739 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPRP00739 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPRP00739 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPRP00739 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPRP00739 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPRP00739 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HPRP00739 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HPRP00739 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HPRP00739 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPRP00739 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPRP00739 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPRP00739 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPRP00739 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPRP00739 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPRP00739 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPRP00739 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPRP00739 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPRP00739 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPRP00739 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPRP00739 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPRP00739 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPRP00739 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPRP00739 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPRP00739 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPRP00739 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPRP00739 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPRP00739 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPRP00739 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPRP00739 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPRP00739 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPRP00739 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPRP00739 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPRP00739 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPRP00739 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPRP00739 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPRP00739 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPRP00739 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPRP00739 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPRP00739 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPRP00739 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HPRP00739 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPRP00739 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPRP00739 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPRP00739 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPRP00739 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HPRP00739 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPRP00739 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPRP00739 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPRP00739 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPRP00739 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPRP00739 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPRP00739 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPRP00739 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPRP00739 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPRP00739 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPRP00739 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPRP00739 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPRP00739 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPRP00739 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPRP00739 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPRP00739 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPRP00739 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPRP00739 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPRP00739 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPRP00739 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPRP00739 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPRP00739 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPRP00739 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPRP00739 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPRP00739 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPRP00739 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPRP00739 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPRP00739 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPRP00739 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPRP00739 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPRP00739 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPRP00739 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPRP00739 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPRP00739 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPRP00739 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPRP00739 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPRP00739 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPRP00739 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPRP00739 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HPRP00739 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPRP00739 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPRP00739 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HPRP00739 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPRP00739 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPRP00739 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPRP00739 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms