Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms