Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF6O94906 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms