Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFASCO94856 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFASCO94856 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NFASCO94856 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFASCO94856 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFASCO94856 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFASCO94856 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFASCO94856 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFASCO94856 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NFASCO94856 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFASCO94856 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFASCO94856 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFASCO94856 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFASCO94856 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFASCO94856 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NFASCO94856 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFASCO94856 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFASCO94856 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFASCO94856 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFASCO94856 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NFASCO94856 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFASCO94856 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFASCO94856 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NFASCO94856 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NFASCO94856 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NFASCO94856 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NFASCO94856 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFASCO94856 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NFASCO94856 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFASCO94856 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFASCO94856 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFASCO94856 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFASCO94856 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFASCO94856 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NFASCO94856 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFASCO94856 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFASCO94856 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NFASCO94856 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NFASCO94856 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFASCO94856 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFASCO94856 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFASCO94856 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFASCO94856 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFASCO94856 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFASCO94856 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFASCO94856 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFASCO94856 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFASCO94856 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFASCO94856 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFASCO94856 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFASCO94856 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFASCO94856 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFASCO94856 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFASCO94856 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFASCO94856 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFASCO94856 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFASCO94856 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFASCO94856 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFASCO94856 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFASCO94856 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFASCO94856 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFASCO94856 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFASCO94856 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFASCO94856 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFASCO94856 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFASCO94856 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFASCO94856 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NFASCO94856 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFASCO94856 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFASCO94856 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFASCO94856 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFASCO94856 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFASCO94856 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFASCO94856 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NFASCO94856 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NFASCO94856 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NFASCO94856 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFASCO94856 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFASCO94856 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFASCO94856 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFASCO94856 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFASCO94856 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFASCO94856 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFASCO94856 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFASCO94856 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFASCO94856 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFASCO94856 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NFASCO94856 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFASCO94856 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFASCO94856 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFASCO94856 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFASCO94856 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFASCO94856 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFASCO94856 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFASCO94856 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFASCO94856 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFASCO94856 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFASCO94856 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NFASCO94856 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFASCO94856 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms