Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCATO75600 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCATO75600 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCATO75600 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCATO75600 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCATO75600 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCATO75600 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCATO75600 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCATO75600 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCATO75600 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCATO75600 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCATO75600 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCATO75600 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCATO75600 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCATO75600 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCATO75600 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCATO75600 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCATO75600 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GCATO75600 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCATO75600 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCATO75600 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCATO75600 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GCATO75600 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCATO75600 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCATO75600 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCATO75600 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCATO75600 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCATO75600 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCATO75600 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCATO75600 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCATO75600 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCATO75600 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCATO75600 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCATO75600 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCATO75600 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCATO75600 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCATO75600 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCATO75600 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GCATO75600 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCATO75600 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCATO75600 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCATO75600 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCATO75600 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCATO75600 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GCATO75600 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCATO75600 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCATO75600 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCATO75600 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCATO75600 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GCATO75600 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCATO75600 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCATO75600 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCATO75600 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCATO75600 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCATO75600 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCATO75600 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCATO75600 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCATO75600 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCATO75600 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCATO75600 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCATO75600 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCATO75600 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCATO75600 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GCATO75600 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCATO75600 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCATO75600 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCATO75600 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCATO75600 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCATO75600 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GCATO75600 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCATO75600 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCATO75600 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCATO75600 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCATO75600 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCATO75600 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GCATO75600 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCATO75600 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GCATO75600 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCATO75600 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCATO75600 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCATO75600 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCATO75600 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCATO75600 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCATO75600 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCATO75600 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCATO75600 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCATO75600 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCATO75600 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCATO75600 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCATO75600 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCATO75600 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCATO75600 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCATO75600 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCATO75600 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCATO75600 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCATO75600 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCATO75600 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCATO75600 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCATO75600 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCATO75600 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms