Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC22BO75396 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22BO75396 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms