Protein–RNA interactions for Protein: O75096

LRP4, Low-density lipoprotein receptor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP4O75096 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP4O75096 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP4O75096 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP4O75096 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP4O75096 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP4O75096 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP4O75096 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP4O75096 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP4O75096 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP4O75096 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP4O75096 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP4O75096 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP4O75096 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP4O75096 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP4O75096 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP4O75096 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP4O75096 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP4O75096 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP4O75096 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP4O75096 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP4O75096 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP4O75096 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP4O75096 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP4O75096 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP4O75096 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP4O75096 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP4O75096 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP4O75096 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP4O75096 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP4O75096 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP4O75096 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP4O75096 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP4O75096 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP4O75096 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP4O75096 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP4O75096 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP4O75096 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP4O75096 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP4O75096 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP4O75096 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP4O75096 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP4O75096 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP4O75096 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP4O75096 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP4O75096 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP4O75096 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP4O75096 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP4O75096 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP4O75096 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP4O75096 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP4O75096 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP4O75096 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP4O75096 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP4O75096 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP4O75096 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP4O75096 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP4O75096 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP4O75096 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP4O75096 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP4O75096 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP4O75096 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP4O75096 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP4O75096 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP4O75096 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP4O75096 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP4O75096 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP4O75096 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP4O75096 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP4O75096 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP4O75096 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP4O75096 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP4O75096 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP4O75096 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP4O75096 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP4O75096 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP4O75096 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP4O75096 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP4O75096 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP4O75096 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP4O75096 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP4O75096 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP4O75096 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP4O75096 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP4O75096 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP4O75096 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP4O75096 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP4O75096 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP4O75096 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP4O75096 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP4O75096 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP4O75096 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP4O75096 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP4O75096 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP4O75096 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP4O75096 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP4O75096 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP4O75096 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP4O75096 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP4O75096 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP4O75096 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms