Protein–RNA interactions for Protein: O60583

CCNT2, Cyclin-T2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT2O60583 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT2O60583 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms