Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA2O43921 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms