Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGTAO43765 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGTAO43765 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGTAO43765 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGTAO43765 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGTAO43765 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGTAO43765 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGTAO43765 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGTAO43765 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGTAO43765 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGTAO43765 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGTAO43765 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGTAO43765 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGTAO43765 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGTAO43765 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGTAO43765 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGTAO43765 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGTAO43765 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SGTAO43765 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGTAO43765 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGTAO43765 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGTAO43765 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGTAO43765 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGTAO43765 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGTAO43765 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGTAO43765 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGTAO43765 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGTAO43765 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGTAO43765 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGTAO43765 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGTAO43765 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGTAO43765 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGTAO43765 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGTAO43765 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGTAO43765 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGTAO43765 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGTAO43765 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGTAO43765 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGTAO43765 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGTAO43765 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGTAO43765 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGTAO43765 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGTAO43765 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGTAO43765 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGTAO43765 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGTAO43765 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGTAO43765 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGTAO43765 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGTAO43765 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGTAO43765 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGTAO43765 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGTAO43765 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGTAO43765 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGTAO43765 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGTAO43765 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGTAO43765 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGTAO43765 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGTAO43765 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGTAO43765 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGTAO43765 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGTAO43765 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGTAO43765 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGTAO43765 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGTAO43765 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGTAO43765 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGTAO43765 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGTAO43765 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGTAO43765 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGTAO43765 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGTAO43765 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGTAO43765 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGTAO43765 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGTAO43765 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGTAO43765 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SGTAO43765 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGTAO43765 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGTAO43765 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGTAO43765 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGTAO43765 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGTAO43765 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGTAO43765 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGTAO43765 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGTAO43765 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGTAO43765 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGTAO43765 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGTAO43765 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGTAO43765 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGTAO43765 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGTAO43765 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGTAO43765 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGTAO43765 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGTAO43765 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGTAO43765 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGTAO43765 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGTAO43765 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGTAO43765 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGTAO43765 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGTAO43765 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGTAO43765 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGTAO43765 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms