Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CYTH3O43739 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms