Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
HTATSF1O43719 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms