Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GATCO43716 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GATCO43716 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GATCO43716 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GATCO43716 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GATCO43716 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GATCO43716 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GATCO43716 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GATCO43716 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GATCO43716 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GATCO43716 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GATCO43716 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GATCO43716 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GATCO43716 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GATCO43716 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GATCO43716 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GATCO43716 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GATCO43716 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GATCO43716 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATCO43716 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATCO43716 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATCO43716 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GATCO43716 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATCO43716 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATCO43716 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GATCO43716 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATCO43716 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATCO43716 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATCO43716 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATCO43716 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATCO43716 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATCO43716 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATCO43716 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATCO43716 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATCO43716 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GATCO43716 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GATCO43716 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GATCO43716 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GATCO43716 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GATCO43716 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GATCO43716 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GATCO43716 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GATCO43716 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GATCO43716 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GATCO43716 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GATCO43716 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GATCO43716 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GATCO43716 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GATCO43716 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATCO43716 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATCO43716 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATCO43716 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATCO43716 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATCO43716 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATCO43716 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GATCO43716 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATCO43716 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATCO43716 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATCO43716 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATCO43716 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATCO43716 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATCO43716 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATCO43716 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATCO43716 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATCO43716 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATCO43716 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATCO43716 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATCO43716 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATCO43716 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATCO43716 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATCO43716 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATCO43716 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATCO43716 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATCO43716 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATCO43716 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATCO43716 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATCO43716 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATCO43716 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATCO43716 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATCO43716 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATCO43716 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATCO43716 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATCO43716 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATCO43716 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATCO43716 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATCO43716 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATCO43716 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GATCO43716 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GATCO43716 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GATCO43716 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GATCO43716 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GATCO43716 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GATCO43716 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GATCO43716 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GATCO43716 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GATCO43716 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GATCO43716 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GATCO43716 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GATCO43716 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GATCO43716 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms