Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHMP2AO43633 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms