Protein–RNA interactions for Protein: O43612

HCRT, Orexin, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCRTO43612 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCRTO43612 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCRTO43612 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCRTO43612 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCRTO43612 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCRTO43612 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCRTO43612 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCRTO43612 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCRTO43612 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCRTO43612 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCRTO43612 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCRTO43612 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCRTO43612 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCRTO43612 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCRTO43612 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HCRTO43612 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCRTO43612 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCRTO43612 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCRTO43612 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCRTO43612 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCRTO43612 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCRTO43612 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCRTO43612 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCRTO43612 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCRTO43612 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCRTO43612 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCRTO43612 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HCRTO43612 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HCRTO43612 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HCRTO43612 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HCRTO43612 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HCRTO43612 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HCRTO43612 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HCRTO43612 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HCRTO43612 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HCRTO43612 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HCRTO43612 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCRTO43612 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCRTO43612 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCRTO43612 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCRTO43612 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCRTO43612 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCRTO43612 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCRTO43612 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCRTO43612 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCRTO43612 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCRTO43612 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCRTO43612 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCRTO43612 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCRTO43612 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCRTO43612 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCRTO43612 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCRTO43612 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCRTO43612 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCRTO43612 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCRTO43612 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCRTO43612 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCRTO43612 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCRTO43612 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCRTO43612 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCRTO43612 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCRTO43612 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCRTO43612 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCRTO43612 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCRTO43612 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HCRTO43612 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCRTO43612 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCRTO43612 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCRTO43612 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCRTO43612 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCRTO43612 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCRTO43612 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCRTO43612 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCRTO43612 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCRTO43612 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCRTO43612 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCRTO43612 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCRTO43612 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCRTO43612 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCRTO43612 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCRTO43612 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HCRTO43612 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCRTO43612 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCRTO43612 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCRTO43612 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCRTO43612 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCRTO43612 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCRTO43612 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCRTO43612 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCRTO43612 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCRTO43612 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCRTO43612 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCRTO43612 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCRTO43612 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCRTO43612 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCRTO43612 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCRTO43612 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCRTO43612 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCRTO43612 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HCRTO43612 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms