Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ERI3O43414 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERI3O43414 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERI3O43414 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERI3O43414 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERI3O43414 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERI3O43414 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERI3O43414 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERI3O43414 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERI3O43414 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERI3O43414 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERI3O43414 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERI3O43414 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ERI3O43414 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERI3O43414 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERI3O43414 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERI3O43414 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERI3O43414 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERI3O43414 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERI3O43414 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERI3O43414 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERI3O43414 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERI3O43414 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERI3O43414 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERI3O43414 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERI3O43414 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERI3O43414 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERI3O43414 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERI3O43414 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERI3O43414 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERI3O43414 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERI3O43414 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERI3O43414 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERI3O43414 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERI3O43414 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERI3O43414 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERI3O43414 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERI3O43414 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERI3O43414 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERI3O43414 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERI3O43414 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERI3O43414 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERI3O43414 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERI3O43414 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERI3O43414 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERI3O43414 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERI3O43414 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERI3O43414 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERI3O43414 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERI3O43414 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERI3O43414 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERI3O43414 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERI3O43414 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERI3O43414 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERI3O43414 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ERI3O43414 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERI3O43414 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERI3O43414 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERI3O43414 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERI3O43414 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERI3O43414 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERI3O43414 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERI3O43414 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERI3O43414 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERI3O43414 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERI3O43414 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERI3O43414 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERI3O43414 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERI3O43414 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERI3O43414 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERI3O43414 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERI3O43414 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERI3O43414 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERI3O43414 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERI3O43414 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERI3O43414 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERI3O43414 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERI3O43414 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERI3O43414 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERI3O43414 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERI3O43414 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERI3O43414 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERI3O43414 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERI3O43414 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERI3O43414 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERI3O43414 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERI3O43414 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERI3O43414 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERI3O43414 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERI3O43414 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERI3O43414 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERI3O43414 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERI3O43414 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERI3O43414 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERI3O43414 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ERI3O43414 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERI3O43414 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERI3O43414 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERI3O43414 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERI3O43414 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms