Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK2O43353 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPK2O43353 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms