Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAP3K13O43283 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms