Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 LYZ-201ENST00000261267 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.262e-42■■■■■ 31.9
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RBFOX2O43251 TTC28-207ENST00000490475 724 ntTSL 57.94□□□□□ -1.141e-8■■■■■ 31.8
RBFOX2O43251 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.466e-7■■■■■ 31.8
RBFOX2O43251 TBC1D8-201ENST00000376840 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.746e-7■■■■■ 31.8
RBFOX2O43251 SRSF6-202ENST00000483871 1680 ntTSL 211.25□□□□□ -0.618e-16■■■■■ 31.8
RBFOX2O43251 SRSF6-201ENST00000244020 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.168e-16■■■■■ 31.8
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RBFOX2O43251 AGAP1-208ENST00000448025 757 ntTSL 57.16□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 31.8
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RBFOX2O43251 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 31.7
RBFOX2O43251 C19orf12-203ENST00000392275 1188 ntTSL 217.9■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 31.7
RBFOX2O43251 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 31.7
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RBFOX2O43251 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 31.7
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RBFOX2O43251 RBM12-204ENST00000424458 1068 ntTSL 219.78■□□□□ 0.763e-14■■■■■ 31.7
RBFOX2O43251 CPNE1-207ENST00000414664 1070 ntTSL 519.78■□□□□ 0.763e-14■■■■■ 31.7
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RBFOX2O43251 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.323e-14■■■■■ 31.7
RBFOX2O43251 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.523e-14■■■■■ 31.7
RBFOX2O43251 CPNE1-215ENST00000437100 826 ntTSL 511.73□□□□□ -0.533e-14■■■■■ 31.7
RBFOX2O43251 CPNE1-208ENST00000414711 673 ntTSL 511.22□□□□□ -0.613e-14■■■■■ 31.7
RBFOX2O43251 CPNE1-206ENST00000412056 998 ntTSL 310.97□□□□□ -0.653e-14■■■■■ 31.7
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RBFOX2O43251 CPNE1-218ENST00000439806 748 ntTSL 58.65□□□□□ -1.023e-14■■■■■ 31.7
RBFOX2O43251 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.093e-14■■■■■ 31.7
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RBFOX2O43251 CPNE1-214ENST00000435747 400 ntTSL 37.78□□□□□ -1.163e-14■■■■■ 31.7
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RBFOX2O43251 GPI-203ENST00000586077 3053 nt9.18□□□□□ -0.941e-17■■■■■ 31.7
RBFOX2O43251 RERE-213ENST00000480342 2710 ntTSL 28.31□□□□□ -1.081e-6■■■■■ 31.6
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RBFOX2O43251 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.384e-11■■■■■ 31.6
RBFOX2O43251 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.384e-11■■■■■ 31.6
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RBFOX2O43251 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.634e-8■■■■■ 31.6
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RBFOX2O43251 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.797e-7■■■■■ 31.6
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RBFOX2O43251 DCTN1-201ENST00000361874 4500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.96e-7■■■■■ 31.6
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RBFOX2O43251 DCTN1-205ENST00000409567 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.16e-7■■■■■ 31.6
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RBFOX2O43251 SH3BP2-227ENST00000515183 566 ntTSL 410.99□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 31.5
RBFOX2O43251 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.633e-16■■■■■ 31.5
RBFOX2O43251 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.663e-16■■■■■ 31.5
RBFOX2O43251 TMOD1-203ENST00000395211 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.093e-16■■■■■ 31.5
RBFOX2O43251 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 31.5
RBFOX2O43251 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.096e-9■■■■■ 31.5
RBFOX2O43251 PLEKHG2-208ENST00000478523 664 ntTSL 514.25□□□□□ -0.136e-9■■■■■ 31.5
RBFOX2O43251 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.416e-9■■■■■ 31.5
RBFOX2O43251 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.566e-9■■■■■ 31.5
RBFOX2O43251 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.586e-9■■■■■ 31.5
RBFOX2O43251 PLEKHG2-201ENST00000205135 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.09□□□□□ -0.636e-9■■■■■ 31.5
RBFOX2O43251 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.666e-9■■■■■ 31.5
RBFOX2O43251 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.746e-9■■■■■ 31.5
RBFOX2O43251 MANBA-201ENST00000226578 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.796e-9■■■■■ 31.5
RBFOX2O43251 TRNT1-202ENST00000280591 2180 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.96e-9■■■■■ 31.5
RBFOX2O43251 MANBA-207ENST00000514430 7444 ntTSL 27.21□□□□□ -1.266e-9■■■■■ 31.5
RBFOX2O43251 TRNT1-208ENST00000434583 1871 ntTSL 26.96□□□□□ -1.36e-9■■■■■ 31.5
RBFOX2O43251 WDR43-205ENST00000446643 579 ntTSL 44.69□□□□□ -1.669e-10■■■■■ 31.5
RBFOX2O43251 LINC-PINT-206ENST00000435523 553 ntTSL 33.44□□□□□ -1.866e-9■■■■■ 31.5
RBFOX2O43251 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 31.4
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