Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBDO15205 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBDO15205 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBDO15205 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBDO15205 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBDO15205 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBDO15205 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBDO15205 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBDO15205 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBDO15205 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBDO15205 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBDO15205 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBDO15205 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBDO15205 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBDO15205 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBDO15205 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBDO15205 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBDO15205 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBDO15205 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBDO15205 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBDO15205 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBDO15205 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBDO15205 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBDO15205 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBDO15205 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBDO15205 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBDO15205 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBDO15205 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBDO15205 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBDO15205 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBDO15205 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBDO15205 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBDO15205 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBDO15205 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBDO15205 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBDO15205 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBDO15205 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBDO15205 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBDO15205 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBDO15205 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBDO15205 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBDO15205 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBDO15205 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBDO15205 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBDO15205 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBDO15205 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBDO15205 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBDO15205 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBDO15205 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBDO15205 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBDO15205 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBDO15205 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBDO15205 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBDO15205 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBDO15205 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBDO15205 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBDO15205 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBDO15205 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBDO15205 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBDO15205 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBDO15205 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBDO15205 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBDO15205 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBDO15205 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBDO15205 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBDO15205 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBDO15205 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBDO15205 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBDO15205 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBDO15205 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBDO15205 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBDO15205 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBDO15205 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBDO15205 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBDO15205 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBDO15205 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBDO15205 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBDO15205 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBDO15205 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBDO15205 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBDO15205 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBDO15205 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBDO15205 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBDO15205 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBDO15205 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBDO15205 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBDO15205 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBDO15205 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBDO15205 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBDO15205 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBDO15205 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBDO15205 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBDO15205 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBDO15205 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBDO15205 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBDO15205 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBDO15205 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBDO15205 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBDO15205 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBDO15205 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms