Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3EO15041 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3EO15041 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3EO15041 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3EO15041 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3EO15041 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3EO15041 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEMA3EO15041 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEMA3EO15041 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SEMA3EO15041 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SEMA3EO15041 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SEMA3EO15041 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA3EO15041 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA3EO15041 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA3EO15041 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA3EO15041 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA3EO15041 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA3EO15041 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA3EO15041 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA3EO15041 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA3EO15041 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3EO15041 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3EO15041 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3EO15041 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3EO15041 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3EO15041 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3EO15041 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3EO15041 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3EO15041 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3EO15041 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3EO15041 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SEMA3EO15041 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SEMA3EO15041 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms