Protein–RNA interactions for Protein: O14894

TM4SF5, Transmembrane 4 L6 family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5O14894 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF5O14894 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF5O14894 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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