Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDC80O14777 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDC80O14777 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDC80O14777 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDC80O14777 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDC80O14777 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDC80O14777 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDC80O14777 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDC80O14777 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDC80O14777 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDC80O14777 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDC80O14777 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDC80O14777 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDC80O14777 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NDC80O14777 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDC80O14777 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDC80O14777 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDC80O14777 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDC80O14777 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDC80O14777 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDC80O14777 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDC80O14777 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDC80O14777 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDC80O14777 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDC80O14777 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDC80O14777 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDC80O14777 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDC80O14777 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDC80O14777 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDC80O14777 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDC80O14777 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NDC80O14777 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDC80O14777 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDC80O14777 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDC80O14777 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDC80O14777 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDC80O14777 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDC80O14777 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDC80O14777 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDC80O14777 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDC80O14777 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDC80O14777 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDC80O14777 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDC80O14777 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDC80O14777 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDC80O14777 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDC80O14777 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDC80O14777 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDC80O14777 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDC80O14777 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDC80O14777 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDC80O14777 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDC80O14777 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDC80O14777 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDC80O14777 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDC80O14777 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDC80O14777 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDC80O14777 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDC80O14777 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDC80O14777 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NDC80O14777 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDC80O14777 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDC80O14777 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDC80O14777 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDC80O14777 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDC80O14777 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NDC80O14777 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDC80O14777 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDC80O14777 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDC80O14777 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDC80O14777 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDC80O14777 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDC80O14777 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDC80O14777 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDC80O14777 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDC80O14777 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDC80O14777 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDC80O14777 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDC80O14777 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDC80O14777 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDC80O14777 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDC80O14777 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NDC80O14777 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDC80O14777 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDC80O14777 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDC80O14777 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDC80O14777 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDC80O14777 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDC80O14777 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDC80O14777 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDC80O14777 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDC80O14777 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDC80O14777 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDC80O14777 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDC80O14777 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDC80O14777 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDC80O14777 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDC80O14777 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDC80O14777 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDC80O14777 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms