Protein–RNA interactions for Protein: O14562

UBFD1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1O14562 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBFD1O14562 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBFD1O14562 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms